Antrajame "Filognozijos pradmenų" tome išplečiamos pirmojo tomo temos, pagilinama filognozijos sąvoka, išryškinamos pagrindinės kryptys, atskleidžiant sątvarologijos ir substratologijos pagrindines prielaidas bei pagrindinius žmogaus ir tikrovės pažinimo organizavimo principus. Supažindinama su žmogaus sąmonės sandara, jos užvaldymo galimybėmis ir su tuo susijusiais etikos klausimais.